More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2271 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  293  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 163 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 197 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  37.23 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  30.83 
 
 		 157 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  33.02 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  34.38 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  39.39 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  32.08 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  32.08 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  32.08 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  32.08 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 161 aa  66.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  33.83 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 163 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  28.15 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  29.69 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  24.8 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  38.24 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  32.35 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>