281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0786 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  313  8e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
303 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  30.23 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.08 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  30.47 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
183 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  25 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
171 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  26.56 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  34.07 
 
 
292 aa  50.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  22.88 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  23.66 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  23.68 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  28.17 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  22.03 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
139 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  25.86 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  26.96 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
223 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  21.97 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
182 aa  47.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 
175 aa  47.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
149 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
139 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
159 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  21.8 
 
 
140 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  24.78 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  22.02 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  22.02 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  22.02 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  29.36 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.36 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  36 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  20.31 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>