More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3117 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  40.85 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 168 aa  87  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  34.81 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  31.91 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  34.91 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  30.72 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  34.26 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  33.61 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  32.06 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31.07 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 304 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 329 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  28.7 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 314 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  21.09 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>