More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1325 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  333  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 154 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  39.72 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  40.69 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  40.44 
 
 		 151 aa  97.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 144 aa  94.4  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 148 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  34.81 
 
 		 149 aa  90.9  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 149 aa  88.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  38.97 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  33.58 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  34.07 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  29.91 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  30.4 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  43.24 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>