More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3866 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  298  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 152 aa  123  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  46.77 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  45.16 
 
 		 164 aa  103  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  35.04 
 
 		 151 aa  86.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  29.93 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 185 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  30.88 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  37.12 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 304 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  26.81 
 
 		 168 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 179 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  27.07 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  29.66 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  34.74 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  35.85 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  35.85 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>