263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1800 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  44.76 
 
 		 180 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  37.8 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  34.81 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  29.85 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  32.2 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 139 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  32.12 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.59 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.59 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 340 aa  51.2  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 340 aa  51.2  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  35.11 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  35.11 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  33.02 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 326 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  26.06 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>