120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0634 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  324  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  59.74 
 
 		 162 aa  200  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  35.51 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  33.55 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  30.08 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  33.03 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 304 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  33.82 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  29.06 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  23.7 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  20.83 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  20.3 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  23.81 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  20.35 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.72 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  22.69 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 347 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 158 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>