More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1374 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  296  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  43.97 
 
 		 160 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  40.74 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 164 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  39.26 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 185 aa  94.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  38.76 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  40.15 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  32.14 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  33.81 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 304 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  29.32 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 304 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 183 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  35.71 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2666  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  31.03 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1590  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.298967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2637  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2682  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435685  normal  0.104112 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.91 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  26.95 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>