93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2682 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2682  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435685  normal  0.104112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2637  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2666  MarR family transcriptional regulator  99.36 
 
 
157 aa  306  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  73.12 
 
 
165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  38.55 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
178 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 
166 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
149 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
149 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
149 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
149 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
176 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  41.05 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
166 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  44.44 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
212 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
194 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
197 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  37.11 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
147 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  34.48 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1599  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
179 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 
178 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  30.61 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
165 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  34.57 
 
 
170 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  28.57 
 
 
163 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  22.7 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
176 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 
172 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
171 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.3 
 
 
141 aa  40.4  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 
153 aa  40.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>