More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2076 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  81.07 
 
 		 171 aa  280  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  77.22 
 
 		 168 aa  254  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  33.13 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 199 aa  98.2  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  30.71 
 
 		 149 aa  90.5  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  29.93 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 147 aa  72  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 304 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  28.08 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  29.01 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  23.74 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.26 
 
 		 308 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  26.19 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  23.58 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  26.32 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 139 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  27.27 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>