More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1954 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  320  4e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  48.59 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  28.68 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  27.41 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  25.95 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  25.95 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1636  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.95 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.95 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.95 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.95 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.95 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.95 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.19 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 169 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  28.46 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  27.34 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  24.59 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  26.9 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  24.8 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  24.37 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>