More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2803 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 170 aa  330  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  68.06 
 
 		 151 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  68.92 
 
 		 153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  69.78 
 
 		 157 aa  180  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  63.38 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3865  MarR family transcriptional regulator  69.06 
 
 		 148 aa  177  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115918  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  56.03 
 
 		 166 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  59.42 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 163 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  52.94 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  52.32 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  55.73 
 
 		 155 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  51.45 
 
 		 155 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 178 aa  134  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.64 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 144 aa  127  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  46.62 
 
 		 150 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.09 
 
 		 141 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  45.19 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 151 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 151 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 145 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 149 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  48.46 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  45.91 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  48.06 
 
 		 151 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 153 aa  124  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  46.45 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  46.9 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  44.53 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  45.86 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 151 aa  121  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  44.08 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  45.21 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  48.46 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38.69 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38.69 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  47.68 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  46.97 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  48.65 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  45.59 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  43.97 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  46.62 
 
 		 146 aa  118  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  41.3 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  45.93 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  44.09 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  46.97 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  46.97 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>