More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0968 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  296  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  59.71 
 
 		 146 aa  168  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 145 aa  166  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  62.81 
 
 		 171 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  60.33 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  62.3 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  58.87 
 
 		 148 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 155 aa  153  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  54.86 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  61.15 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  59.71 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 156 aa  143  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 148 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  62.22 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  59.35 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  43.38 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  42.65 
 
 		 149 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  59.22 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  45.3 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 171 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  36.8 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  32.33 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 132 aa  66.6  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4115  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  33.06 
 
 		 162 aa  60.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  31.54 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  36.08 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>