More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1956 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  309  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  57.5 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  49.62 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  38.93 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  31.34 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  27.91 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  25.64 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.46 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  26.43 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  33.05 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  28.69 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  33.05 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.06 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.06 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  33.05 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.31 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  27.48 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  25 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.24 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>