More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0651 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
172 aa  350  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  62.94 
 
 
184 aa  174  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
188 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
189 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  41.79 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
150 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 
176 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
151 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 
151 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
148 aa  100  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
161 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  49.47 
 
 
172 aa  94.4  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
315 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 
150 aa  91.3  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
175 aa  90.9  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
151 aa  88.6  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
178 aa  87.8  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
158 aa  84.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 
155 aa  82  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 
139 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
139 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
139 aa  72  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
142 aa  72  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  29.05 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
145 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  34.43 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>