More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4545 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  91.28 
 
 		 151 aa  277  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  46.81 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 176 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 169 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 172 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 151 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 150 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 178 aa  98.2  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 176 aa  97.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 161 aa  97.4  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 174 aa  90.9  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 159 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 315 aa  87  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  28.91 
 
 		 140 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  34.02 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  26.71 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  29.29 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>