More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1140 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  100 
 
 
144 aa  286  8e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  57.34 
 
 
158 aa  160  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  51.77 
 
 
152 aa  144  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  54.74 
 
 
149 aa  144  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 
154 aa  133  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  51.06 
 
 
157 aa  130  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 
149 aa  110  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  52.94 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.45 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
244 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
174 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
180 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
170 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
172 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  29.57 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  38 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
303 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
194 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1485  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252569  normal  0.356309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
205 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
157 aa  52  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  27.73 
 
 
169 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.82 
 
 
287 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
161 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  33.87 
 
 
162 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
315 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
158 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 
172 aa  50.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
148 aa  50.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  32.56 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
149 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  25 
 
 
177 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 
142 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  31.71 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  27.21 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  32.29 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
168 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>