More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3853 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 162 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  67.9 
 
 		 194 aa  210  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  68.12 
 
 		 164 aa  204  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  66.67 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  66.46 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  68.49 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  66.46 
 
 		 196 aa  190  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  63.92 
 
 		 170 aa  190  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  63.4 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  58.39 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8615  putative transcriptional regulator, MarR family  65.82 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  65.16 
 
 		 188 aa  172  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  57.5 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  53.42 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13350  transcriptional regulator, MarR family  59.49 
 
 		 177 aa  147  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.083551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 164 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  48.08 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  52.24 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 180 aa  127  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  54.84 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  48.05 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  43.04 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 179 aa  123  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  46.34 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  49.25 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  43.03 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  44.3 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  44.87 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  43.67 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  35.06 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  35.62 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 191 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 191 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  36.81 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 212 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  35.33 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 183 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 197 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 178 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  38.85 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1159  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  43.05 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 161 aa  97.1  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1590  regulatory protein, MarR  37.91 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.298967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 325 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  45.16 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7540  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  39.61 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0833  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4979  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2699  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170019  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4886  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  35.22 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  32.24 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.33 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.33 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.33 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.33 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>