More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2559 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
179 aa  366  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  90.12 
 
 
175 aa  313  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  68.29 
 
 
180 aa  236  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  75.34 
 
 
174 aa  224  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  69.33 
 
 
187 aa  224  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  53.5 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  49.39 
 
 
166 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 
166 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  54.81 
 
 
164 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  54.81 
 
 
164 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  48.77 
 
 
166 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  54.81 
 
 
164 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  54.81 
 
 
164 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  54.81 
 
 
164 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  54.81 
 
 
164 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  54.81 
 
 
164 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
164 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  44.03 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  46.01 
 
 
166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  50.7 
 
 
176 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  50.7 
 
 
176 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  41.51 
 
 
160 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  48.17 
 
 
177 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 
164 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  51.85 
 
 
165 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  50.31 
 
 
162 aa  141  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
177 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  52.59 
 
 
171 aa  141  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  48.1 
 
 
165 aa  138  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
165 aa  137  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1590  regulatory protein, MarR  50 
 
 
160 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.298967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  44.94 
 
 
194 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  46.5 
 
 
163 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  43.98 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  45.34 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  46.63 
 
 
163 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  39.62 
 
 
163 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  39.39 
 
 
167 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  40.83 
 
 
183 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  44.38 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  44.94 
 
 
164 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
172 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  41.78 
 
 
169 aa  124  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  42.94 
 
 
196 aa  123  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  43.75 
 
 
162 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
168 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
176 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
192 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  42.01 
 
 
170 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
166 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1159  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
166 aa  121  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462298  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  41.21 
 
 
178 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
197 aa  121  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 
191 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
191 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  40.61 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 
166 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 
179 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  40.25 
 
 
168 aa  117  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  42.14 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  41.77 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8615  putative transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 
180 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
164 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  39.51 
 
 
157 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  39.04 
 
 
170 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  40.76 
 
 
188 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
172 aa  99  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 
162 aa  98.2  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13350  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 
177 aa  95.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.083551  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
174 aa  94.7  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  37.98 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 
325 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2699  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 
164 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170019  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  35.9 
 
 
165 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  32.41 
 
 
165 aa  85.5  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  33.14 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4886  MarR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7540  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  30.57 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2316  transcriptional regulator  31.69 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4979  transcriptional regulator, MarR family  29.38 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0833  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146161  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0374  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 
250 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.724626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>