More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5658 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 170 aa  327  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  44.23 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  39.07 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  47.1 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  45.06 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 166 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  37.01 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  41.14 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  41.06 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  42.28 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  36.77 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 192 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  42.24 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 178 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  42.76 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  98.2  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  39.39 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  40.25 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  39.46 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  38.62 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 180 aa  94.4  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1590  regulatory protein, MarR  33.55 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.298967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 174 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  90.9  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 		 187 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  33.74 
 
 		 179 aa  87.4  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  35.22 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  35.8 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  35.95 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  33.95 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8615  putative transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13350  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.083551  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  36.03 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2699  transcriptional regulator, MarR family  40.99 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170019  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  34.78 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  37.09 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1159  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  32.28 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>