More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1313 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  100 
 
 		 165 aa  313  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2666  MarR family transcriptional regulator  74.19 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2637  MarR family transcriptional regulator  73.12 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2682  MarR family transcriptional regulator  73.12 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435685  normal  0.104112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  45.75 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  38.12 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  39.75 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  35.76 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  36.2 
 
 		 183 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  40.69 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 168 aa  98.6  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2316  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 167 aa  97.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 164 aa  97.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 179 aa  97.4  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  40.36 
 
 		 170 aa  94  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  29.68 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  41.88 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  37.34 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1590  regulatory protein, MarR  31.61 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.298967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  87.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  36.31 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  36.18 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  28.39 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  38.12 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  29.94 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  30.13 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  29.01 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  33.54 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  29.68 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8615  putative transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  35.22 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  30.41 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  32.24 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1159  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13350  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.083551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  34.59 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  33.76 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  31.29 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  33.97 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  31.5 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>