More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0270 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  329  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 180 aa  167  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  52.9 
 
 		 166 aa  166  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  53.5 
 
 		 179 aa  163  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  48.43 
 
 		 166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  51.88 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  58.21 
 
 		 187 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  51.59 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  43.83 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  47.2 
 
 		 191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 198 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  44.52 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  57.46 
 
 		 174 aa  153  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  47.8 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1590  regulatory protein, MarR  48.41 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.298967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 178 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 197 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 192 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 179 aa  150  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  51.61 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  46.95 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  46.54 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  43.23 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  49.02 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  49.69 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  49.68 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  44.65 
 
 		 194 aa  144  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  47.37 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 177 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  47.33 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  43.95 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  43.9 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  44.85 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  45.95 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  47.1 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  47.4 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  47.26 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  47.22 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  45.86 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  45.06 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  44.67 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  45.22 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  46.41 
 
 		 173 aa  130  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  44.52 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  42.58 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  46.98 
 
 		 188 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  44.97 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  43.62 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8615  putative transcriptional regulator, MarR family  44.87 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 325 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1159  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  38.56 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  42.76 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13350  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.083551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 174 aa  97.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2699  transcriptional regulator, MarR family  41.5 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170019  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  35.44 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 182 aa  90.5  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7540  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  38.56 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4886  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 203 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  32.89 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0374  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  32.82 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.02 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4979  transcriptional regulator, MarR family  31.79 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>