More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5532 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 175 aa  353  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  60.98 
 
 		 165 aa  201  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  33.13 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  33.97 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  31.01 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  29.75 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  32.33 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  30.32 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  30.97 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  30.13 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  29.8 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  29.14 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  31.85 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  28.99 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  26.32 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1159  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  27.39 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2699  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170019  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1590  regulatory protein, MarR  26.02 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.298967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  24.38 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  28.91 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0374  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 250 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  27.39 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7540  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  28.3 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>