More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3100 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
170 aa  342  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  70.62 
 
 
166 aa  237  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  69.38 
 
 
167 aa  235  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  58.13 
 
 
181 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  55 
 
 
177 aa  177  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  52.47 
 
 
174 aa  176  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  55 
 
 
168 aa  175  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  55 
 
 
177 aa  174  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  56.17 
 
 
178 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  56.52 
 
 
162 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  52.5 
 
 
173 aa  168  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  53.37 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  52.02 
 
 
173 aa  160  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
168 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  51.2 
 
 
207 aa  155  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  50.94 
 
 
170 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  50.3 
 
 
185 aa  144  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  48.75 
 
 
165 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
180 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 
165 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  44.17 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  44.38 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  41.6 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  37.01 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
157 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 
145 aa  61.6  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
170 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
145 aa  60.8  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
146 aa  60.8  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  33.12 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
152 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  34.27 
 
 
163 aa  58.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  34.51 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
149 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
143 aa  57.8  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  35.96 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
139 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
138 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  38.21 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 
155 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  38.89 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
138 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  32.46 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  50.82 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
153 aa  55.1  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
183 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
146 aa  54.7  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
155 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  32.58 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
159 aa  54.3  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>