More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6082 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 167 aa  339  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  76.69 
 
 		 166 aa  263  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  69.38 
 
 		 170 aa  235  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  54.37 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  55.83 
 
 		 168 aa  181  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  55.62 
 
 		 181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  52.5 
 
 		 173 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  52.47 
 
 		 174 aa  175  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  54.32 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  56.88 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  51.88 
 
 		 178 aa  163  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  51.22 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 170 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 180 aa  141  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  47.8 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  46.43 
 
 		 185 aa  139  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  44.91 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  43.12 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  41.53 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  35.16 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  28.7 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  34.56 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  28.57 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.23 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>