261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4553 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  83.67 
 
 		 166 aa  254  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 169 aa  193  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 189 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 189 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  41.38 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  33.8 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  41.58 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 181 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  37.96 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  40.62 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  37.08 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  25.6 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  30.08 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  29.29 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  25.55 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  28.46 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 186 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  32 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>