More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3861 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  90.67 
 
 		 150 aa  254  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  72.06 
 
 		 151 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  72.06 
 
 		 151 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 151 aa  204  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  75.19 
 
 		 151 aa  204  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 169 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  43.52 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 189 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  34.33 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  30 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  27.64 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  34.19 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  35.14 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  31 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  26.71 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  39.24 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  30.09 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 183 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  42.47 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  34.09 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  31.5 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  32.67 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 143 aa  48.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  31.58 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>