More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1008 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  299  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  90.44 
 
 		 151 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  89.71 
 
 		 151 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  89.71 
 
 		 151 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  76.74 
 
 		 150 aa  207  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  75.78 
 
 		 150 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 166 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 189 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 189 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  34.06 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  30.67 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  41.18 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  31.91 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  30.33 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  32.48 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  35.77 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  31.88 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 194 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  34.78 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 179 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  31.78 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>