More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4070 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  376  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  88.76 
 
 		 186 aa  328  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  86.34 
 
 		 187 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 162 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 168 aa  188  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 167 aa  187  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  50.29 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 158 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  56 
 
 		 175 aa  177  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 161 aa  177  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  47.7 
 
 		 194 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  47.7 
 
 		 194 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  56.38 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  59.71 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  41.88 
 
 		 186 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 158 aa  111  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 157 aa  111  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.01 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  38.98 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  39.66 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  34.71 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  35.24 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  34.45 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  35.04 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  43.01 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  43.9 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5199  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>