More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3506 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  343  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  60.12 
 
 		 166 aa  207  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  63.83 
 
 		 147 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 189 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  48.94 
 
 		 163 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 162 aa  143  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  41.74 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  38.17 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  29.94 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  36.61 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  33.04 
 
 		 140 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  34.62 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  27.41 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  34.69 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.17 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.17 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  29.17 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.97 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 136 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  27.48 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  34.04 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 166 aa  50.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>