219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0733 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  83.83 
 
 		 189 aa  285  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  86.42 
 
 		 162 aa  283  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  84.43 
 
 		 189 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  83.44 
 
 		 163 aa  280  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  81.48 
 
 		 162 aa  263  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  52.14 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  48.57 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  36.97 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  37.16 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  31.54 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  27.46 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.34 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.5 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  34.51 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.06 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  26.87 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  25.19 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  32.54 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  33.58 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  28.85 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 233 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  23.97 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  22.82 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 176 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>