More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1577 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
176 aa  348  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  45.32 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
163 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
157 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  42.25 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  44.74 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  44.95 
 
 
164 aa  90.9  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  41.78 
 
 
169 aa  90.9  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  48.51 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 
159 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  40.69 
 
 
159 aa  88.6  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  46.22 
 
 
156 aa  87.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 
166 aa  87.4  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  41.46 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
233 aa  84.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  34.46 
 
 
158 aa  84.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  40.25 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  42.74 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  43.55 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  39.23 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 
152 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  38.78 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  37.32 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  41.28 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  36.88 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  38.97 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  44.94 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  38.33 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
157 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  36.64 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  31.21 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  43.16 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  39.47 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  37.12 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  43.01 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  42.2 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
213 aa  67  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  37.31 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  35.9 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  35.17 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  46.25 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 
151 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 
134 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 
155 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 
155 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  35.85 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 
193 aa  60.8  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>