More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14940 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  57.32 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  54.73 
 
 		 163 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  52.38 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 213 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  50.99 
 
 		 168 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  58.22 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  52.82 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  45.81 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 163 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  46.58 
 
 		 154 aa  131  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  45.52 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  44.37 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  51.45 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  44.85 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 197 aa  127  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 		 155 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  45.21 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 166 aa  124  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  41.81 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  46.2 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  42.13 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  43.05 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  45.52 
 
 		 194 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 		 159 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  43.45 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  40.76 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  43.45 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 150 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  43.45 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 151 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  37.59 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 151 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  39.04 
 
 		 164 aa  99  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 151 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 151 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  35.98 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 159 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 159 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 		 160 aa  90.9  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  38.19 
 
 		 166 aa  90.9  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 157 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 161 aa  89.4  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 161 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 171 aa  88.6  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  38.93 
 
 		 161 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 165 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 165 aa  84.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  34.48 
 
 		 163 aa  84.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  35.57 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  34.45 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>