181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11940 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  355  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  50.34 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  48.99 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  47.95 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  46.53 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  47.14 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  43.54 
 
 		 160 aa  124  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  43.15 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  44.22 
 
 		 163 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  45.03 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  42.47 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  44.37 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  40.67 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  43.97 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  45.14 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  35.17 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  41.13 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 159 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  41.06 
 
 		 168 aa  98.2  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 160 aa  98.2  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 159 aa  97.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  95.5  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 213 aa  94.7  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 168 aa  94.4  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  39.04 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  40.56 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  36.55 
 
 		 153 aa  89  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  36.48 
 
 		 158 aa  88.6  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 197 aa  87.8  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  39.04 
 
 		 155 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  37.16 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 150 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  38.06 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 155 aa  85.1  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 151 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 151 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 151 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  39.1 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 152 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  35.06 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  32.41 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  36.02 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  32.89 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  28.75 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  28 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  30.7 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  34.48 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>