291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2351 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 166 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  82.82 
 
 		 165 aa  274  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  46.1 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  45.14 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  45.39 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  44.53 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  40.97 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  37.93 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  37.24 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  39.72 
 
 		 193 aa  95.9  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  35.1 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  40.69 
 
 		 169 aa  91.3  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  38.19 
 
 		 182 aa  90.9  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  36.88 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  37.34 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  39.72 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  33.95 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  36.31 
 
 		 200 aa  80.9  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  35.22 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  35.71 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  33.8 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  36.88 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  35.17 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  31.54 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  32.87 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  34.53 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  34.87 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  34.53 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>