243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3028 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 172 aa  343  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  80.95 
 
 		 168 aa  269  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  47.65 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  44.52 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 		 155 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  40.12 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  45.1 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  43.38 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  43.8 
 
 		 158 aa  97.8  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 155 aa  87.8  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 151 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 150 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  34.75 
 
 		 175 aa  84.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  33.54 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  35.57 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  35.22 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  39.44 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  35.67 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  34.36 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  35.97 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  30.92 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  36 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  32.14 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  29.88 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  27.16 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  34.21 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  30.87 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5500  hypothetical protein  41.98 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.599586  normal  0.0270035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>