More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1280 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 172 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  42.14 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 164 aa  84  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  35.76 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 189 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  36.03 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  29.58 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  31.88 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 184 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  36.79 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  44.83 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  44.04 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  30.53 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  38.26 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  32.79 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>