More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4315 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  340  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  43.27 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  42.14 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  41.84 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  40 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  48.05 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  45.21 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.27 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0285  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.742627  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  38.94 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  41 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  37.37 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  34.17 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  37.93 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  32.52 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  34.82 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  33.87 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>