More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1213 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  59.23 
 
 		 164 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 168 aa  148  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 162 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 161 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 162 aa  131  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 		 187 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 185 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  124  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 158 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  43.66 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 157 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 161 aa  97.8  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  31.2 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.63 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.63 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.99 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  31.63 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  30.14 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  30.7 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  31.87 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  36.72 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>