More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0126 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  69.01 
 
 
150 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  68.53 
 
 
151 aa  193  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
184 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  47.92 
 
 
193 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  48.91 
 
 
158 aa  120  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  51.72 
 
 
171 aa  117  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
159 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  45.52 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 
159 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
168 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  39.04 
 
 
164 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 
163 aa  103  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  43.17 
 
 
159 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  48.8 
 
 
168 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  43.57 
 
 
158 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  49.59 
 
 
166 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
163 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  41.5 
 
 
159 aa  100  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
166 aa  100  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  41.55 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  44.72 
 
 
182 aa  98.6  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  41.5 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  45.53 
 
 
154 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  45.14 
 
 
169 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  45.53 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  36.81 
 
 
170 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  45.53 
 
 
172 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  41.13 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  45.53 
 
 
160 aa  94.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  39.19 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
153 aa  94  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  46.03 
 
 
161 aa  93.6  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  42.25 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  42.07 
 
 
194 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  45.58 
 
 
186 aa  91.3  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
159 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
159 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
160 aa  88.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
163 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
213 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  42.06 
 
 
197 aa  85.9  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  36.42 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  37.32 
 
 
180 aa  84.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
197 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  32.64 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  38.19 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  38.4 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  34.04 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  33.11 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  39.84 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  39.2 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  40.65 
 
 
200 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
176 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  33.83 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
176 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
176 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5500  hypothetical protein  45.33 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.599586  normal  0.0270035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
166 aa  58.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
176 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>