229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3374 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  317  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
184 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 
159 aa  130  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 
193 aa  130  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  46.85 
 
 
168 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  45.67 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
155 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
151 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  45.32 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  42.36 
 
 
159 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  42.36 
 
 
149 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  47.37 
 
 
171 aa  107  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
168 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  43.06 
 
 
158 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  43.57 
 
 
168 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
163 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  39.73 
 
 
170 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 
159 aa  100  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
166 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  41.78 
 
 
154 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 
157 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  40.41 
 
 
169 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  44.37 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  40.67 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  38.89 
 
 
170 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  40.97 
 
 
159 aa  95.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 
186 aa  95.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  39.07 
 
 
166 aa  91.3  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  39.58 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  39.58 
 
 
151 aa  91.3  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  41.73 
 
 
197 aa  90.9  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  39.37 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  40.97 
 
 
194 aa  90.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  38.19 
 
 
200 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  36.42 
 
 
174 aa  88.2  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 
161 aa  88.6  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
197 aa  87.8  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  38.76 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  37.91 
 
 
175 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 
172 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  35.86 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  38.19 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
213 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  39.37 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  39.67 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  36.11 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  35.77 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  34.65 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  30.77 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 
183 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>