More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4108 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
137 aa  266  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  96.8 
 
 
137 aa  236  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  93.6 
 
 
137 aa  229  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  57.52 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  58.72 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  47.2 
 
 
140 aa  100  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 
128 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  43.75 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  41.96 
 
 
154 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  41.88 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  43.44 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  42.2 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  39.18 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 
155 aa  76.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  41.11 
 
 
163 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  39.81 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  39.82 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
157 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  39.67 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  41.94 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  46.91 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 
167 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  33.02 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  45.33 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 
180 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  39.77 
 
 
194 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  33.75 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  34.58 
 
 
160 aa  57.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  42.03 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 
172 aa  57  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
189 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  31.93 
 
 
201 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
164 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
169 aa  53.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  31.43 
 
 
158 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
135 aa  52  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
148 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
147 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
166 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 
182 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>