278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1275 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  323  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  59.13 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  48.06 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  47.75 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  39.82 
 
 		 153 aa  87.8  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  43.81 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  38.39 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  36.72 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  37.19 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  40 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  35.25 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  36.46 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  40.45 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  41.25 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  34.91 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  32.14 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  35.48 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>