294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002615 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 140 aa  284  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  86.13 
 
 		 137 aa  246  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2268  regulatory protein, MarR  33.77 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  31.53 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  32.14 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  30.19 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 156 aa  50.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  40.62 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  33.71 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  35.92 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  30.43 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  31.82 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.77 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.77 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.77 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.77 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  30.71 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.77 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  31.52 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.77 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  31.82 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  32.58 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  32.58 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  28.68 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  24.6 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  31.21 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  34.83 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  32.39 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  33.71 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  26.77 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  32.39 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  31.21 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  31.21 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>