270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3906 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  57.35 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  57.66 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  56.52 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  55.88 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  42.24 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  43.75 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  37.07 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  38.98 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 159 aa  72  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  37.69 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  37.61 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  33.96 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  37 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  35.45 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  33.72 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  33.33 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 194 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>