291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2322 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 193 aa  381  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  52.78 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 		 159 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  49.01 
 
 		 158 aa  138  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  47.26 
 
 		 155 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 159 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  48.67 
 
 		 159 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 150 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 163 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 151 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  41.81 
 
 		 182 aa  121  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 159 aa  121  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  43.24 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  47.1 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  40.67 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  43.26 
 
 		 168 aa  111  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 153 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  43.05 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  44.44 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  44.85 
 
 		 149 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  42.95 
 
 		 154 aa  104  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  45.1 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 166 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 		 161 aa  101  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 163 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  38.71 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 168 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 162 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 151 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 163 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  39.72 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  95.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  39.04 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 165 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 161 aa  91.7  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 160 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  40.28 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 160 aa  89.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 160 aa  88.6  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 157 aa  88.2  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  35.76 
 
 		 168 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  34.64 
 
 		 155 aa  87.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 151 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 166 aa  85.5  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  34.62 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  35.86 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 166 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  30.77 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  35.1 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 157 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5500  hypothetical protein  42.11 
 
 		 102 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.599586  normal  0.0270035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  36.07 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>