264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2376 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 170 aa  339  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  52.5 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  46.34 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  47.45 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  47.79 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  46.53 
 
 		 180 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  47.79 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  43.79 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  44.97 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  43.92 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  44.22 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  43.62 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  41.29 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  44.52 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  41.29 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  43.36 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  40.67 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  42.21 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  40.65 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  39.6 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  40.29 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  34.87 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  37.78 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  40 
 
 		 175 aa  91.3  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 159 aa  90.5  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  38.51 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  38.46 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  39.87 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  35.21 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  31.87 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 197 aa  85.1  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 213 aa  84.3  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  33.95 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  33.57 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  31.61 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  34.01 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  30.38 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  39.47 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  39.47 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  43.16 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>