More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0889 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  79.86 
 
 		 172 aa  219  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  51.43 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  66.96 
 
 		 167 aa  140  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  50 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  50.75 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  39.44 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  42.36 
 
 		 172 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 233 aa  90.5  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  42.62 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 197 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  37.23 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  39.2 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  36.57 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  48.98 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  41.6 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  44.44 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 		 180 aa  80.5  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  42.98 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  36.13 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  32.89 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  40.62 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  38.06 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  42.73 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  40.38 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  33.57 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  43.62 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  37.1 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  39.29 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  34.64 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>