191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8160 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  66.96 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  58.41 
 
 		 137 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  53.79 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  57.52 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 140 aa  97.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  39.82 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  36 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  36.59 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  38.58 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 176 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 176 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 176 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  34.41 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 233 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  32.35 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  37.5 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 189 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  41.89 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34890  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.7983  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  34.09 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  42.11 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2045  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  31.3 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  35.71 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  29.46 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>