More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1717 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  64.71 
 
 
156 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  52.94 
 
 
128 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  47.15 
 
 
155 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  47.75 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  41.88 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  46.6 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  44.34 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  46.6 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  38.58 
 
 
154 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  43.44 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  38.79 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
233 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  41.28 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  43.43 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  39.62 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  45.57 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  44.32 
 
 
194 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  36.89 
 
 
160 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  35.65 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 
175 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  41.11 
 
 
158 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  44.3 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  38.21 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  34.55 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  42.5 
 
 
197 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 
155 aa  57.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 
174 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 
164 aa  57  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 
172 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
166 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  38.83 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
166 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 
153 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  30.43 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 
177 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  37.08 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  36.27 
 
 
261 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  34.65 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  47.92 
 
 
147 aa  52  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
156 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 
177 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
197 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 
163 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  35.56 
 
 
166 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
184 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>